Un cofattore sta rapidamente portando sul mercato il test predittivo per l'immunoterapia con i dati di Intermountain Spinout

NEW YORK – Dopo aver annunciato all'inizio di questa settimana una collaborazione con Culmination Bio, spin-out di Intermountain Health, Cofactor Genomics si sta "muovendo in modo aggressivo" per far avanzare il test OncoPrism per prevedere se i pazienti affetti da una serie di tumori potrebbero trarre beneficio dall'immunoterapia.

Cofactor, con sede a San Francisco, ha convalidato OncoPrism, un test di sottotipizzazione delle cellule T e quantificazione delle cellule immunitarie basato sul sequenziamento dell'RNA, nell'ambito dello studio PREDAPT utilizzando campioni di tumore non identificati e dati clinici abbinati. L'obiettivo, secondo il CEO di Cofactor Jarret Glasscock, è commercializzare OncoPrism come strumento per identificare quali pazienti hanno maggiori probabilità di rispondere agli inibitori del checkpoint PD-1/L1 come Keytruda di Merck (pembrolizumab) o Opdivo di Bristol Myers Squibb (nivolumab).

Lo studio osservazionale e prospettico ha un obiettivo di arruolamento di 1.650 pazienti con 11 tipi di cancro. Ma la nuova partnership Culmination è anche fondamentale per convalidare il test, ha affermato Glasscock, poiché consente a Cofactor di accedere a un database di 4,5 milioni di campioni di pazienti, ciascuno abbinato a dati longitudinali sugli esiti clinici e al sequenziamento dell'intero genoma, del trascrittoma, dell'esoma, della proteomica, e altre analisi omiche.

Questa raccolta di dati, che Culmination chiama Culmination Intelligence Platform, è la sua offerta a partner come Cofactor. Sebbene la validazione prospettica di OncoPrism utilizzando campioni raccolti in PREDAPT sia fondamentale per dimostrare le sue prestazioni predittive su più tipi di cancro, Glasscock ha affermato che i dati di Culmination offrono a Cofactor vantaggi significativi, in termini non solo di numero di campioni di pazienti nell'archivio ma anche di tempo.

"Abbiamo bisogno di conoscere i risultati sui pazienti di questi trattamenti immunoterapici [per convalidare OncoPrism]. Con i dati prospettici raccolti nell'ambito di PREDAPT, dobbiamo attendere mesi prima che i risultati dispongano di dati completi", ha affermato Glasscock. "Con studi prospettici, stiamo aspettando che i pazienti [rispondano], e il valore di Culmination Bio è che hanno questi campioni di pazienti e i dati dei pazienti di alta qualità già raccolti e archiviati. Ci consente di muoverci molto più rapidamente con i nostri sforzi."

Il test OncoPrism di Cofactor è essenzialmente una piattaforma di profilazione immunitaria, come lo ha descritto Glasscock. "Stiamo esaminando le firme di espressione genica più informative che si associano ai tipi di cellule immunitarie e agli stati delle cellule immunitarie che sono più predittivi dei potenziali soggetti che risponderanno e non risponderanno all'immunoterapia", ha affermato, spiegando che la piattaforma OncoPrism produce essenzialmente una misurazione di questi molteplici analiti. "Il punto in cui entrano in gioco i dati clinici è l'addestramento del modello per dirci: 'Che aspetto ha un profilo per i risponditori nel cancro del polmone? Che aspetto ha un profilo di non-responder?'"

Sebbene la piattaforma OncoPrism sia già stata creata, i milioni di dati clinici collegati nella Culmination Intelligence Platform aiuteranno Cofactor ad addestrare il suo test per prevedere la risposta immunoterapica in vari tipi di cancro e a farlo molto più rapidamente.

Finora, Cofactor ha compiuto i maggiori progressi validando OncoPrism per prevedere quali pazienti affetti da cancro della testa e del collo trarranno beneficio dall’immunoterapia, che Glasscock ha definito “l’indicazione della testa di ponte” dell’azienda. Nel settembre 2022, l'azienda ha presentato dati che dimostrano che OncoPrism prevedeva il beneficio anti-PD-1 tra i pazienti affetti da cancro della testa e del collo in modo più accurato rispetto all'espressione PD-L1 basata sull'immunoistochimica, che molti oncologi considerano un "pessimo biomarcatore" per identificare i migliori rispondenti all'immunoterapia . In quello studio, OncoPrism ha dimostrato un’accuratezza del 75% nel prevedere i soggetti che hanno risposto agli inibitori del checkpoint immunitario, mentre i test immunoistochimici per PD-L1 avevano un’accuratezza del 42%.

Con questa lettura dei dati, Cofactor è "a buon punto con il cancro della testa e del collo" e mira a commercializzare OncoPrism in quell'ambiente come test sviluppato in laboratorio in "un futuro molto prossimo", secondo Glasscock. Ha aggiunto che l'azienda sta già lavorando con medici in tutto il paese per prepararsi al rilascio commerciale nel cancro della testa e del collo entro la fine dell'anno e poco dopo sta esaminando lo spazio del cancro ai polmoni.